人間の組織リポジトリと組織分析

The Human Tissue Repository and Tissue Analysis Shared Resource (HTR-TASR) is jointly funded by the UNM Comprehensive Cancer Center and the Department of Pathology. The HTR-TASR is アメリカ病理学者大学(CAP)による認定.

The HTR-TASR has been set up to facilitate the translational research of the faculty in the UNM Cancer Center, the Department of Pathology, the School of Medicine and across Institutes. This website describes the services offered and contact details of HTR-TASR staff members who can advise on specimen availability and all aspects of histology and molecular pathology.

目的

適切な倫理的、科学的、および立法上の原則と規制を遵守しながら、科学的調査で使用するための高品質のヒト組織サンプルの取得、保管、およびUNM研究者への配布を容易にするため。

私たちは、使用  生物試料リソースのNCIベストプラクティス 私たちのガイドとして。

HTR-Tissueについて

HTR-組織共有リソース:

  • 他の方法では利用できない可能性のある、よく保存および維持されている組織へのアクセスを研究者に許可することにより、将来の患者に利益をもたらします
  • 革新的で臨床的に価値のある研究を促進することにより、質の高い患者ケアを提供するという使命を強化することにより、UNMHSCに利益をもたらします
  • 18のHIPAA個人識別子を欠いた匿名化された標本の調剤におけるHTRの正直なブローカー機能は、潜在的なHIPAAの合併症/違反から研究者を保護します

TASRはさまざまな 組織学サービス処理およびパラフィン包埋、パラフィンおよび凍結切片、H&E 染色、IHC 染色、TMA 構築、スライドのデジタル化、および画像解析を含みます。

助成金申請のためのHTR-TASRサービスの概要

Human Tissue Repository and Tissue Analysis Shared Resource(HTR-TASR)には、さまざまな手法を実行する機能があり、サービスベースの料金でさまざまなサービスを提供します。

HTR-TASR は、主に残った廃棄手術標本から適合する正常組織と腫瘍組織を収集し、凍結またはホルマリン固定パラフィン包埋 (FFPE) ブロックとして保存します。研究者は、IRB (ヒト研究保護局) と科学審査委員会 (SRC) の承認を得て組織を要求できます。

HTR-TASR は、Ventana Discovery Ultra プラットフォームを使用した切片作成および H&E 染色、免疫組織化学および免疫蛍光、カスタム組織マイクロアレイ (TMA) の作成、Aperio AT2 を使用したスライドのデジタル化 (明視野)、HALO™ プラットフォーム (Indica Labs、本社はニューメキシコ州アルバカーキ) を使用した画像分析など、さまざまな組織学および分子サービスも提供できます。

Nexelom Cellometer 1000を介した細胞数や生存率のパフォーマンスなど、さまざまなタイプの血液処理が利用できます。

研究者によっては、特別に準備された標本が必要であったり、特定の標本要件がある場合があります。これらの承認された研究については、HTR のスタッフが事前に標本を収集し、研究者のニーズに合わせて処理します。希望するサービスについて話し合うために、技術マネージャーと実現可能性会議を設定する必要があります。

この共有リソースの使用を認めるには、出版物に以下を含めてください。

この研究は、UNM包括的がんセンターサポート助成金NCI P30CA118100によって部分的にサポートされ、ニューメキシコ大学医学部病理学部から追加のサポートを受けているヒト組織リポジトリと組織分析共有リソースを利用しました。

HTR-Tissueにお問い合わせください

電話番号:(505)272-1127
Eメール:issuebank@salud.unm.edu
フィッツホールの部屋306B、および306C
UNMHSC医学部
病理学科
MSC 08-4640
915カミノ・デ・サラード、北東
アルバカーキ、NM 87131

HTR-TAの担当者

ジョステ・ナンシーcc.jpgナンシージョステ、MD

病理学部教授・学部長

医長

リソースの品質管理の側面を監督します

キャスリーン・マルティネス、PDキャスリーンマルティネスPA

技術部長

リソースの技術的側面を監督します

フレッドシュルツ、マサチューセッツ州フレッドシュルツ、マサチューセッツ州

情報学管理

組織学および分子病理学サービス

組織の処理、パラフィン包埋、パラフィン切片作成、組織の急速凍結、凍結切片作成。パラフィン切片と凍結切片の H&E 染色。

実験室では、すでに実施されているプロトコルを使用して、標準的な抗体で組織切片を染色できます。 あるいは、実験室は、染色結果を最適化するために複数の染色の組み合わせを可能にするVENTANADISCOVERYプラットフォームを使用して抗体を処理することができます。

HER-2およびER画像
HER-2とERの二重染色
HTR組織マイクロアレイ-e-カドヘリン

組織マイクロアレイの設計と構築:これには、ドナーパラフィンブロックの収集、コアに関心のある領域の選択、およびコアをブランクのレシピエントパラフィンブロックに配置することが含まれます。 50つのスライドで複数のサンプルを評価できるため、速度とコストに利点があります。 一般的なTMAには、直径200mm〜0.6 mmのコアが約2.0〜50個含まれています。 XNUMXつのTMAブロックから約XNUMXのセクションを取得できます。

 

(右:E-カドヘリン)

HTR-TASRの担当者は、UNM病院からアーカイブ組織ブロックを取得できます。

これは通常、外科病理学者の顕微鏡レビューのために診断サンプルが採取され、患者ケアのための将来の潜在的な検査のために十分な標本がパラフィンに保持された後、外科的切除時に残った過剰または残存組織の収集を含みます。 HTR-TASRの担当者は、UNMHSC外科病理学の肉眼的解剖室で組織を収集します。 現在、HTRは静脈穿刺を行っていませんが、研究者の要求に応じてそのような標本を保管します。

HTR-TASRプロジェクトコンサルタントは、一致するサンプルにコード化されている間にHIPAA識別子が削除された病理学および臨床データを収集できます。

画像解析

H&E または免疫組織化学的に染色された組織切片の画像は、ライカ AT2 デジタル スキャナーでキャプチャされ、HALO イメージングおよび注釈ソフトウェアにアップロードされます。

HALOソフトウェアを使用すると、組織(腫瘍、間質、筋肉、脂肪など)に注釈を付けてから、これらの注釈付き領域のそれぞれで選択したタンパク質(図、右)が陽性の細胞を数えることができます。 また、最近傍の相互作用を分析および定量化することもできます。

このソフトウェアには、参照フレームやスケールバーなどの公開可能な形式で画像のマルチパネル写真を作成できる図形作成ツールが含まれています。

定量的結果画像

この図は、乳がんにおけるKi67の染色の定量化を示しています。 左上のパネルは組織マイクロアレイサンプルを示し、中央のパネルはHALOマークアップなしのKi67染色(茶色)を示し、右のパネルはHALOマークアップありの同じ画像を示しています。

マークアップは、腫瘍細胞の核におけるKi67の低レベルの染色(黄色)、中程度の染色(茶色)、および高レベル(赤)を示しています。 青い染色は、Ki67が陰性の細胞です。 ソフトウェアは、腫瘍のストーマにおけるKi67染色を独立してカウントできます。

この表は、各染色カテゴリーの細胞数とパーセンテージの読み取り値を示し、ヒストグラムは染色の分布を示しています。

標本の申請方法

連絡先 キャシーマルティネス スケジュールに沿って。

iLabでアカウントを開きます。

  1. に移動します iLabsログインページ.
  2. 画面の右上隅で、を選択します アカウント登録
  3. サインアップページの登録フォームに記入してください。
  4. ログイン資格情報と手順が記載されたウェルカムメールをiLabから受信します

iLabでのサービスのリクエスト:

  1. 部門を通じて購買依頼(PR)を確立します。 PRをに電子メールで送信 パラクシ・レディ・バンダパリ iLabシステムのラボの下に追加するように要求します。
  2. に行きます iLabsログイン ページで見やすくするために変数を解析したりすることができます。
  3. このページの右上隅に、ユーザー名とパスワードを入力します。
  4. 「サービスのリクエスト」タブで、「リクエストの開始」をクリックします。
  5. HTRにリクエストを送信する前に、フォームに記入し、リクエストの支払い情報を入力してください。
    1. プロジェクトタイトルと SRC/HRRC/IACUC 番号が承認レターに記載されているものと一致していることを確認してください。
    2. サービスの各カテゴリの下に、目的の番号を入力し、[選択したサービスを追加]タブをクリックします。 フォームの下部にサービスが追加されます。
    3. 「追加情報」ボックスを使用して重要な詳細を追加し、標本リストや方向の説明などの関連ドキュメントを添付/アップロードします。
  6. リクエストはHTRによるレビューが保留され、HTRは必要な変更を加え、承認のために送信します。 更新されたプロジェクトリクエストに関するメールがiLabから届きます。
  1. 提案を科学審査委員会 (SRC) に提出してください。 エルネスティン・アルミヨに問い合わせる このプロセスのガイダンス。
  2. SRCがあなたの提案を承認したら、申請書と一緒に承認書をUNMに送ってください。 人体実験審査委員会(HRRC)機関審査委員会(IRB).

IRB申請プロセスをナビゲートするには:

  1. 上記のリンクで、左側の「ClickIRB」ボタンをクリックします
  2. 画面上部の[IRB]タブをクリックします
  3. 左側の「新規スタディの作成」ボタンをクリックします
  4. フォームに記入する
  5. 質問#7で、リンクをクリックしてライブラリに移動し、研究に適したプロトコルを選択します
    1. 匿名化された資料のみが必要な研究の場合は、Exempt Category 4 Protocol(HRP-582)を選択してください。 *注:匿名化された廃棄組織は同意を必要としない場合があります
    2. 研究で生きている個人に関する情報を取得する必要がない場合は、Nonhuman Subject Research(HRP-585)を選択してください。
    3. 研究が非研究目的(治療や診断など)のみを目的として収集された標本のみを含む場合は、迅速な提出を提出することができます。
  6. HRRCの承認後、iLabを介してHTRに組織リクエストを送信します。 SRCおよびIRB承認書をアップロードし、システムにアクティブなPRを設定します。
  1. 計画/実現可能性セッションについては、HTR-TASRにお問い合わせください。
  2. 提案を科学審査委員会 (SRC) に提出してください。 エルネスティン・アルミヨに問い合わせる このプロセスのガイダンスについては。
  3. SRC が提案を承認したら、申請書とともに承認書を UNM ヒューマン リサーチ レビュー コミッティ (HRRC) の機関審査委員会 (IRB) に送付してください (上記の手順を参照)。
  4. 追加の計画セッションについては、HTR-TASRに連絡してください(通常、プロセスの詳細を明確にするために必要です。この会議には、国の検査規則と最善の患者ケ​​アの遵守を維持しながら、標本の可用性を確保するために外科病理学部門長からの承認を得ることが含まれます。
  5. 調査の終了後に組織が残っている場合は、HTRに戻す必要があります
  1. 収集した組織の一部が研究に使用される可能性がある場合は、地元の人体実験審査委員会から承認を得る必要があります。
  2. 外科病理学部門長またはその被指名人は、臨床ケアのために十分な代表組織が保持されることを保証するために、サンプル収集の方法を承認する必要があります

棚卸

収集された組織のサイト

(UNMからのアーカイブ組織と、特定の研究のための研究者のための前向きコレクションが含まれます。)

  • 膀胱、血液、骨、骨髄、脳、乳房
  • 胸壁、結腸直腸
  • ダイアフラム
  • 胆嚢
  • 頭と首
  • 腎臓
  • 肝臓、肺、リンパ節
  • 縦隔
  • 大網、卵巣
  • 膵臓、陰茎、腹膜、前立腺
  • 唾液、唾液腺、皮膚、小腸、軟部組織、脾臓、胃
  • 精巣、胸腺、甲状腺
  • 子宮と子宮頸部
  • 膣/外陰部

拡張乳がん登録(EBCR)

これは、収集された組織の複数の時点とタイプを持つ400人を超える同意された患者で構成される複雑な組織収集です。 以下は、各患者について収集されました。

  • 最大5血清アリコート/参加者/コレクション(ベースラインまたはFUP時間など)
  • 最大10血漿アリコート/参加者/コレクション
  • 全血/参加者/コレクションからの10個のDNAアリコート
  • うがい薬または綿棒/参加者/コレクションから最大2つのDNAアリコート
  • 乳房組織(穿刺吸引物、バイアル、OCTカビ)-すべての場合が異なります。

このデータセットの詳細なクエリについては、HTR-TASRにお問い合わせください。