人間の組織リポジトリと組織分析

ヒト組織リポジトリおよび組織分析(HTR-TA)共有リソースは、ニューメキシコ大学総合がんセンターと病理学部によって共同で支援・管理されています。HTR-TA共有リソースは アメリカ病理学者大学(CAP)による認定.

HTR-TA共有リソースは、ニューメキシコ大学がんセンター、病理学部、医学部、そして複数の研究所の教員によるトランスレーショナルリサーチを促進するために設立されました。このウェブサイトでは、HTR-TA共有リソースが提供するサービスと、検体の入手可能性や組織学および分子病理学のあらゆる側面についてアドバイスを提供できるスタッフの連絡先について説明しています。

目的

ヒト組織リポジトリおよび組織分析 (HTR-TA) 共有リソースは、腫瘍組織および対応する正常組織を凍結またはホルマリン固定パラフィン包埋 (FFPE) サンプルとしてユーザーに提供することにより、がんの基礎研究およびトランスレーショナル研究をサポートします。

HTR-TA共有リソースについて

HTR-TA 共有リソース:

  • 他の方法では利用できない可能性のある、よく保存および維持されている組織へのアクセスを研究者に許可することにより、将来の患者に利益をもたらします
  • 革新的で臨床的に価値のある研究を促進することにより、質の高い患者ケアを提供するという使命を強化することにより、UNMHSCに利益をもたらします
  • HTR-TA共有リソースの誠実な仲介機能により、18のHIPAA個人識別情報が含まれない匿名化された検体を分配することで、研究者はHIPAAの潜在的な合併症や違反から保護されます。

HTR-TA共有リソースは、いくつかの重要な 組織学サービス、を含みます:

  • 組織処理およびパラフィン包埋、
  • 断面、
  • H&E染色、
  • i免疫組織化学およびデジタル画像、および
  • 組織標本の保管と放出に加えて、染色切片の分析も行います。

組織は適切な同意が得られた場合のみ採取されます。採取された組織はデータベースに保存され、患者に関する情報(氏名、生年月日、自己申告による人口統計学的分類など)、組織の採取元と診断、組織採取方法、虚血時間、HTR-TA受領後の組織処理方法などの関連情報も含まれています。

現在、HTR-TA には 60,000 個を超える生体試料が保管されており、その中には 20,000 個を超える凍結生体試料、17,000 個を超える FFPE 生体試料、および 7,000 個を超える血液サンプル (全血、血清、血漿、凍結細胞と冷凍保存細胞の両方) が含まれています。

HTR-TA 組織コレクションは、UNMCCC 集水域内の個体群を反映しています。

助成金申請のためのHTR-TA共有リソースサービスの概要

ヒト組織リポジトリおよび組織分析 (HTR-TA) 共有リソースは、さまざまな技術を実行する機能を備えており、有料サービスとしてさまざまなサービスを提供しています。

HTR-TA共有リソースは、主に廃棄された外科手術標本から適合する正常組織と腫瘍組織を収集し、凍結またはホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)ブロックとして保管します。研究者は、IRB(ヒト研究保護局)と科学審査委員会(SRC)の承認を得て、組織を要請することができます。

HTR-TA 共有リソースは、Ventana Discovery Ultra プラットフォームを使用した切片作成および H&E 染色、免疫組織化学および免疫蛍光、カスタム組織マイクロアレイ (TMA) の作成、Aperio AT2 によるスライドのデジタル化 (明視野)、HALO™ プラットフォーム (ニューメキシコ州アルバカーキに本社を置く Indica Labs 製) を使用した画像分析など、さまざまな組織学および分子サービスも提供できます。

Nexelom Cellometer 1000を介した細胞数や生存率のパフォーマンスなど、さまざまなタイプの血液処理が利用できます。

研究者によっては、特別に調製された検体や特別な検体要件を必要とする場合があります。これらの承認された研究については、HTR-TAの共有リソース担当者が事前に検体を収集し、研究者のニーズに合わせて処理を行います。ご希望のサービスについてご相談いただくため、テクニカルマネージャーと実現可能性会議を設定する必要があります。

この共有リソースの使用を認めるには、出版物に以下を含めてください。

この研究は、ニューメキシコ大学総合がんセンター支援助成金 NCI P30CA118100 によって部分的に支援され、ニューメキシコ大学医学部病理学部からの追加支援を受けているヒト組織リポジトリおよび組織分析共有リソースを活用しました。

HTR-TA共有リソースへのお問い合わせ

電話番号:(505)272-1127
Eメール:issuebank@salud.unm.edu
フィッツホールの部屋306B、および306C
UNMHSC医学部
病理学科
MSC 08-4640
915カミノ・デ・サラード、北東
アルバカーキ、NM 87131

リポジトリの標準と認定

UNM HTR-TA共有リソースでは、生体試料管理、品質保証、倫理的監視において最高水準を維持することに尽力しています。私たちの業務は、主要な国内外の組織によって確立された厳格なガイドラインとベストプラクティスに従っています。

  • 国立がん研究所(NCI) – バイオリポジトリおよびバイオサンプル研究部門(BBRB)
    私たちはBBRBの 生物試料リソースのベストプラクティス一貫性と科学的完全性を確保するために、生体試料の収集、処理、保管、配布に関する包括的なガイドラインを提供します。
    https://biospecimens.cancer.gov/default.asp
  • 国際生物環境リポジトリ協会(ISBER)
    HTRはISBERと連携 リポジトリのベストプラクティス生物学および環境科学の研究をサポートするバイオリポジトリの管理とガバナンスの国際的に認められた枠組みです。
    https://www.isber.org/page/BPR
  • 米国病理学会(CAP) – バイオレポジトリ認定プログラム
    HTR は、バイオサンプルの品質、トレーサビリティ、運用の卓越性に関する業界最先端の基準への準拠を証明する、CAP のバイオリポジトリ認定プログラムによる認定を受けたことを誇りに思っています。
    https://www.cap.org/laboratory-improvement/accreditation/biorepository-accreditation-program

これらの基準により、当社の生体試料とサービスは高品質で再現可能な研究をサポートし、がん科学と患者ケアの進歩に有意義に貢献することが保証されます。

HTR-TA共有リソース人員

ジョステ・ナンシーcc.jpgナンシージョステ、MD

病理学部教授・学部長

医長

リソースの品質管理の側面を監督します

キャスリーン・マルティネス、PDキャスリーンマルティネスPA

技術部長

リソースの技術的側面を監督します

フレッドシュルツ、マサチューセッツ州フレッドシュルツ、マサチューセッツ州

情報学管理

組織学および分子病理学サービス

組織の処理、パラフィン包埋、パラフィン切片作成、組織の急速凍結、凍結切片作成。パラフィン切片と凍結切片の H&E 染色。

実験室では、すでに実施されているプロトコルを使用して、標準的な抗体で組織切片を染色できます。 あるいは、実験室は、染色結果を最適化するために複数の染色の組み合わせを可能にするVENTANADISCOVERYプラットフォームを使用して抗体を処理することができます。

HER-2およびER画像
HER-2とERの二重染色
HTR組織マイクロアレイ-e-カドヘリン

組織マイクロアレイの設計と構築:これには、ドナーパラフィンブロックの収集、コアに関心のある領域の選択、およびコアをブランクのレシピエントパラフィンブロックに配置することが含まれます。 50つのスライドで複数のサンプルを評価できるため、速度とコストに利点があります。 一般的なTMAには、直径200mm〜0.6 mmのコアが約2.0〜50個含まれています。 XNUMXつのTMAブロックから約XNUMXのセクションを取得できます。

 

(右:E-カドヘリン)

HTR-TA 共有リソース担当者は、UNM 病院からアーカイブ組織ブロックを取得できます。

これは通常、外科的切除時に診断用サンプルを採取した後に残った余剰組織または残存組織を収集することから成ります。これらの組織は、外科病理医による顕微鏡検査のために採取され、将来の患者ケアのための検査に備えて十分な量の標本がパラフィン中に保存されます。HTR-TAの共有リソース担当者は、ニューメキシコ大学医学部外科病理学教室の肉眼解剖室で組織を収集します。現在、HTR-TAの共有リソースでは静脈穿刺は行っておりませんが、研究者からの要請に応じてこれらの標本を保管します。

 HTR-TA 共有リソース プロジェクト コンサルタントは、一致するサンプルにコード化されながら HIPAA 識別子が削除された病理学データと臨床データを収集できます。

画像解析

H&E または免疫組織化学的に染色された組織切片の画像は、ライカ AT2 デジタル スキャナーでキャプチャされ、HALO イメージングおよび注釈ソフトウェアにアップロードされます。

HALOソフトウェアを使用すると、組織(腫瘍、間質、筋肉、脂肪など)に注釈を付けてから、これらの注釈付き領域のそれぞれで選択したタンパク質(図、右)が陽性の細胞を数えることができます。 また、最近傍の相互作用を分析および定量化することもできます。

このソフトウェアには、参照フレームやスケールバーなどの公開可能な形式で画像のマルチパネル写真を作成できる図形作成ツールが含まれています。

定量的結果画像

この図は、乳がんにおけるKi67の染色の定量化を示しています。 左上のパネルは組織マイクロアレイサンプルを示し、中央のパネルはHALOマークアップなしのKi67染色(茶色)を示し、右のパネルはHALOマークアップありの同じ画像を示しています。

マークアップは、腫瘍細胞の核におけるKi67の低レベルの染色(黄色)、中程度の染色(茶色)、および高レベル(赤)を示しています。 青い染色は、Ki67が陰性の細胞です。 ソフトウェアは、腫瘍のストーマにおけるKi67染色を独立してカウントできます。

この表は、各染色カテゴリーの細胞数とパーセンテージの読み取り値を示し、ヒストグラムは染色の分布を示しています。

標本の申請方法

接触 キャシーマルティネス スケジュールに沿って。

iLabでアカウントを開きます。

  1. に移動します iLabsログインページ.
  2. 画面の右上隅で、を選択します アカウント登録
  3. サインアップページの登録フォームに記入してください。
  4. ログイン資格情報と手順が記載されたウェルカムメールをiLabから受信します

iLabでのサービスのリクエスト:

  1. 部門を通じて購買依頼(PR)を確立します。 PRをに電子メールで送信 パラクシ・レディ・バンダパリ iLabシステムのラボの下に追加するように要求します。
  2. に行きます iLabsログイン ページで見やすくするために変数を解析したりすることができます。
  3. このページの右上隅に、ユーザー名とパスワードを入力します。
  4. 「サービスのリクエスト」タブで、「リクエストの開始」をクリックします。
  5. HTR-TA 共有リソースにリクエストを送信する前に、フォームに記入し、リクエストの支払い情報を入力してください。
    1. プロジェクトタイトルと SRC/HRRC/IACUC 番号が承認レターに記載されているものと一致していることを確認してください。
    2. サービスの各カテゴリの下に、目的の番号を入力し、[選択したサービスを追加]タブをクリックします。 フォームの下部にサービスが追加されます。
    3. 「追加情報」ボックスを使用して重要な詳細を追加し、標本リストや方向の説明などの関連ドキュメントを添付/アップロードします。
  6. リクエストはHTR-TA共有リソースによる審査を待ち、必要な変更を加えて承認を得るために再度提出されます。iLabから更新されたプロジェクトリクエストに関するメールが届きます。
以前に保管した標本を使用するには:
  1. 提案を科学審査委員会 (SRC) に提出してください。 エルネスティン・アルミヨに問い合わせる このプロセスのガイダンス。
  2. SRC アプリケーション (HRP-224) に必要な署名をすべて記入し、SRC に提出してください。
  3. SRCがあなたの提案を承認したら、UNMへの申請書に承認書を添えて提出してください。 人体実験審査委員会(HRRC)機関審査委員会(IRB).

IRB申請プロセスをナビゲートするには:

  1. 上記のリンクで、ページの下部にある「irb.health.unm.edu」ボタンをクリックします。
  2. 画面上部の[IRB]タブをクリックします
  3. 左側の「新規スタディの作成」ボタンをクリックします
  4. フォームに記入する
  5. 質問 7 では、「IRB ライブラリ」リンクをクリックし、研究に適切なプロトコルを選択します。
    1. 研究に必要なのは匿名化された材料のみの場合は、免除カテゴリー4プロトコル(HRP-582)を選択してください。*注:匿名化された廃棄組織については、同意が不要な場合があります。
    2. 研究で生きている個人に関する情報を取得する必要がない場合は、Nonhuman Subject Research(HRP-585)を選択してください。
    3. 研究が非研究目的(治療や診断など)のみを目的として収集された標本のみを含む場合は、迅速な提出を提出することができます。
  6. IRB申請プロセスを進める上でサポートが必要な場合、またはプロジェクトのニーズに最適なプロトコルを特定する必要がある場合は、 エルネスティン・アルミヨに連絡する 支援のため。

HRRCの承認後、iLabを通じてHTR-TA共有リソースに組織リクエストを提出してください。SRCおよびIRBの承認レターをアップロードし、有効な購入依頼書(PR)を提出する必要があります。

iLab のナビゲーション:

  1. MFAデバイスに移動する https://my.ilabsolutions.com/service_center/show_external/3041.
  2. 画面の右上隅で、[登録] を選択します。
  3. 登録フォームに記入します。
  4. ログイン資格情報と手順が記載された iLab からのウェルカム メールを受信します。

iLab でのサービスのリクエスト:

  1. 購入依頼書(PR)を送信する パラクシ・バンダパリ HTR サービスで使用するために iLab アカウントに追加するようリクエストします。
  2. に行く https://my.ilabsolutions.com/service_center/show_external/3041.
  3. ページの右上にある「サインイン」をクリックし、ユーザー名とパスワードを入力します。
  4. 「サービス リクエスト」タブで、Human Tissue Repository & Tissue Analysis Share Resources サービス リクエストの横にある「リクエストの開始」をクリックします。
  5. 適切なSRC/IRB/IACUC承認書のアップロードを含むフォームへの記入を行い、ドロップダウンメニューからPR番号を選択してください。「リクエストを送信」をクリックしてください。
  6. リクエストのステータスはHTRによる審査待ちとなります。必要な変更が行われ、承認のために返送されます。
  7. iLab からの電子メールでプロジェクトのステータスが伝えられます。
  1. 計画/実現可能性セッションについては、HTR-TA 共有リソースにお問い合わせください。
  2. 提案を科学審査委員会 (SRC) に提出してください。 エルネスティン・アルミヨに問い合わせる このプロセスのガイダンスについては。
  3. SRC が提案を承認したら、申請書とともに承認書を UNM ヒューマン リサーチ レビュー コミッティ (HRRC) の機関審査委員会 (IRB) に送付してください (上記の手順を参照)。
  4. 追加の計画セッションについては、HTR-TA 共有リソースにお問い合わせください (通常、プロセスの詳細を明確にするために必要)。この会議には、国の検査室規制の遵守と最善の患者ケ​​アを維持しながら、標本の可用性を確保するために外科病理学部門長からの承認を得ることが含まれます。
  5. 調査終了後に組織が残っている場合は、HTR-TA 共有リソースに返却する必要があります。
  1. 収集した組織の一部が研究に使用される可能性がある場合は、地元の人体実験審査委員会から承認を得る必要があります。
  2. 外科病理学部門長またはその被指名人は、臨床ケアのために十分な代表組織が保持されることを保証するために、サンプル収集の方法を承認する必要があります

棚卸

収集された組織のサイト

(UNMからのアーカイブ組織と、特定の研究のための研究者のための前向きコレクションが含まれます。)

  • 膀胱、血液、骨、骨髄、脳、乳房
  • 胸壁、結腸直腸
  • ダイアフラム
  • 胆嚢
  • 頭と首
  • 腎臓
  • 肝臓、肺、リンパ節
  • 縦隔
  • 大網、卵巣
  • 膵臓、陰茎、腹膜、前立腺
  • 唾液、唾液腺、皮膚、小腸、軟部組織、脾臓、胃
  • 精巣、胸腺、甲状腺
  • 子宮と子宮頸部
  • 膣/外陰部

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拡張乳がん登録(EBCR)

これは、収集された組織の複数の時点とタイプを持つ400人を超える同意された患者で構成される複雑な組織収集です。 以下は、各患者について収集されました。

  • 最大5血清アリコート/参加者/コレクション(ベースラインまたはFUP時間など)
  • 最大10血漿アリコート/参加者/コレクション
  • 全血/参加者/コレクションからの10個のDNAアリコート
  • うがい薬または綿棒/参加者/コレクションから最大2つのDNAアリコート
  • 乳房組織(穿刺吸引物、バイアル、OCTカビ)-すべての場合が異なります。

お近くのLuxinar支社またはディストリビューターに HTR-TA共有リソースに連絡する このデータセットのより詳細なクエリについては。