人間の組織リポジトリと組織分析

Human TissueRepositoryとTissueAnalysis Shared Resource(HTR-TASR)は、CancerCenterとDepartmentofPathologyが共同で資金を提供しています。 これらは、がんセンター、病理学部、医学部、およびさまざまな研究所の教員のトランスレーショナルリサーチを促進するために設置されました。 このウェブサイトでは、提供されるサービスと、標本の入手可能性および組織学と分子病理学のすべての側面についてアドバイスできるHTR-TASRスタッフメンバーの連絡先の詳細について説明しています。

目的

適切な倫理的、科学的、および立法上の原則と規制を遵守しながら、科学的調査で使用するための高品質のヒト組織サンプルの取得、保管、およびUNM研究者への配布を容易にするため。

私たちは、使用 生物試料リソースのNCIベストプラクティス 私たちのガイドとして。

HTR-Tissueについて

HTR-組織共有リソース:

  • 他の方法では利用できない可能性のある、よく保存および維持されている組織へのアクセスを研究者に許可することにより、将来の患者に利益をもたらします
  • 革新的で臨床的に価値のある研究を促進することにより、質の高い患者ケアを提供するという使命を強化することにより、UNMHSCに利益をもたらします
  • 18のHIPAA個人識別子を欠いた匿名化された標本の調剤におけるHTRの正直なブローカー機能は、潜在的なHIPAAの合併症/違反から研究者を保護します

TASRはさまざまな 組織学サービス、さまざまなタイプの免疫組織化学的および免疫蛍光染色、ならびにさまざまな 分子病理学技術 PCR、リアルタイムPCR、組織や体液からのDNAおよびRNA抽出、蛍光抗体法など。

助成金申請のためのHTR-TASRサービスの概要

Human Tissue Repository and Tissue Analysis Shared Resource(HTR-TASR)には、さまざまな手法を実行する機能があり、サービスベースの料金でさまざまなサービスを提供します。

HTR-TASRは、主に残りの廃棄手術標本から一致した正常組織と腫瘍組織を収集し、凍結またはホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)ブロックとして保存します。 研究者は、IRB(Human Research Protections Office)およびTissue Research Oversight Committee(TROC、以前のSRC)からの承認が必要な場合に、組織を要求できます。

HTR-TASRは、セクショニングとH&E染色、Ventana Discovery Ultra Platformを使用した免疫組織化学と免疫蛍光、カスタム組織マイクロアレイ(TMA)の作成、スライドのデジタル化(明視野と蛍光)など、さまざまな組織学と分子サービスを提供することもできます。 Aperio Versa 200、およびHALO™プラットフォームを使用した画像分析(ニューメキシコ州アルバカーキの本社であるIndica Labsから)。

Nexelom Cellometer 1000を介した細胞数や生存率のパフォーマンスなど、さまざまなタイプの血液処理が利用できます。

一部の研究者は、特別に準備された標本を必要とするか、特定の標本要件を持っています。 これらの承認された研究のために、HTRの担当者は、研究者のニーズに合わせて標本とプロセスを前向きに収集します。 さらに、DNAおよびRNA抽出、PCR、リアルタイムPCRなど、いくつかの分子サービスを利用できます。 必要なサービスについて話し合うために、テクニカルマネージャーおよびオペレーションマネージャーとの実現可能性会議を設定する必要があります。

この共有リソースの使用を認めるには、出版物に以下を含めてください。

この研究は、UNM包括的がんセンターサポート助成金NCI P30CA118100によって部分的にサポートされ、ニューメキシコ大学医学部病理学部から追加のサポートを受けているヒト組織リポジトリと組織分析共有リソースを利用しました。

HTR-Tissueにお問い合わせください

電話番号:(505)272-1127
Eメール:issuebank@salud.unm.edu
フィッツホールの部屋306B、および306C
UNMHSC医学部
病理学科
MSC 08-4640
915カミノ・デ・サラード、北東
アルバカーキ、NM 87131

HTR-TAの担当者

デニス・マッキャンス博士デニスJマッキャンス博士

病理学研究教授

科学ディレクター

リソースのすべての側面を監督します

エドガーフィッシャー医学博士エドガーフィッシャー医学博士

病理学教授

医長

リソースの品質管理の側面を監督します

キャスリーン・マルティネス、PDキャスリーンマルティネスPA

技術部長

リソースの技術的側面を監督します

Sadie La Bauve、PhDサディ・ラ・ボーブ博士

運用スペシャリスト

日々の責任を管理します

フレッドシュルツ、マサチューセッツ州フレッドシュルツ、マサチューセッツ州

情報学管理

組織学および分子病理学サービス

組織の処理およびパラフィン包埋または組織の急速凍結。 組織はH&E染色で染色することも、染色しないままにすることもできます。

実験室では、すでに実施されているプロトコルを使用して、標準的な抗体で組織切片を染色できます。 あるいは、実験室は、染色結果を最適化するために複数の染色の組み合わせを可能にするVENTANADISCOVERYプラットフォームを使用して抗体を処理することができます。

HER-2およびER画像
HER-2とERの二重染色

蛍光タグ付き抗体を使用して、目的のタンパク質を検出することもできます。

HTR組織マイクロアレイ-e-カドヘリン

組織マイクロアレイの設計と構築:これには、ドナーパラフィンブロックの収集、コアに関心のある領域の選択、およびコアをブランクのレシピエントパラフィンブロックに配置することが含まれます。 50つのスライドで複数のサンプルを評価できるため、速度とコストに利点があります。 一般的なTMAには、直径200mm〜0.6 mmのコアが約2.0〜50個含まれています。 XNUMXつのTMAブロックから約XNUMXのセクションを取得できます。

 

(右:E-カドヘリン)

HTR-TASRの担当者は、UNM病院からアーカイブ組織ブロックを取得できます。

これは通常、外科病理学者の顕微鏡レビューのために診断サンプルが採取され、患者ケアのための将来の潜在的な検査のために十分な標本がパラフィンに保持された後、外科的切除時に残った過剰または残存組織の収集を含みます。 HTR-TASRの担当者は、UNMHSC外科病理学の肉眼的解剖室で組織を収集します。 現在、HTRは静脈穿刺を行っていませんが、研究者の要求に応じてそのような標本を保管します。

HTR-TASRプロジェクトコンサルタントは、一致するサンプルにコード化されている間にHIPAA識別子が削除された病理学および臨床データを収集できます。

  1. 複数の種類の検体(例、生/凍結血液、形質転換細胞、凍結組織、パラフィン包埋組織)からのDNAおよびRNAの分離。 RNAの定量化と品質評価を含みます。
  2. DNAまたはRNAターゲットからのポリメラーゼ連鎖反応(PCR)増幅。これには、プライマーの設計、PCRの最適化、PCRとRT-PCRのセットアップ、品質保証のためのゲル電気泳動が含まれます。
  3. 遺伝子発現の定量化(リアルタイムPCR):プライマーの設計を含みます。

画像解析

H&Eまたは免疫組織化学的に染色された組織切片または免疫蛍光切片の画像は、Leica Versa 200デジタルスキャナーでキャプチャされ、HALOイメージングおよび注釈ソフトウェアにアップロードされます。

HALOソフトウェアを使用すると、組織(腫瘍、間質、筋肉、脂肪など)に注釈を付けてから、これらの注釈付き領域のそれぞれで選択したタンパク質(図、右)が陽性の細胞を数えることができます。 また、最近傍の相互作用を分析および定量化することもできます。

このソフトウェアには、参照フレームやスケールバーなどの公開可能な形式で画像のマルチパネル写真を作成できる図形作成ツールが含まれています。

定量的結果画像

この図は、乳がんにおけるKi67の染色の定量化を示しています。 左上のパネルは組織マイクロアレイサンプルを示し、中央のパネルはHALOマークアップなしのKi67染色(茶色)を示し、右のパネルはHALOマークアップありの同じ画像を示しています。

マークアップは、腫瘍細胞の核におけるKi67の低レベルの染色(黄色)、中程度の染色(茶色)、および高レベル(赤)を示しています。 青い染色は、Ki67が陰性の細胞です。 ソフトウェアは、腫瘍のストーマにおけるKi67染色を独立してカウントできます。

この表は、各染色カテゴリーの細胞数とパーセンテージの読み取り値を示し、ヒストグラムは染色の分布を示しています。

標本の申請方法

Contact キャシーマルティネス or セイディ・ラボーブ スケジュールに沿って。

iLabでアカウントを開きます。

  1. に移動します iLabsログインページ.
  2. 画面の右上隅で、を選択します サインアップ
  3. サインアップページの登録フォームに記入してください。
  4. ログイン資格情報と手順が記載されたウェルカムメールをiLabから受信します

iLabでのサービスのリクエスト:

  1. 部門を通じて購買依頼(PR)を確立します。 PRをに電子メールで送信 サブリナ・サムディオ-ルイス 及び アベルタランゴ-プリエト iLabシステムのラボの下に追加するように要求します。
  2. に行きます iLabsログイン のページをご覧ください。
  3. このページの右上隅に、ユーザー名とパスワードを入力します。
  4. [サービスのリクエスト]タブで、対象のサービス(Human Tissue Repository vs Molecular Pathology Services)の横にある[InitiateRequest]をクリックします。
  5. HTRにリクエストを送信する前に、フォームに記入し、リクエストの支払い情報を入力してください。
    1. プロジェクトタイトルとTROC / HRRC / IACUC番号が承認書の番号と一致していることを確認してください。
    2. サービスの各カテゴリの下に、目的の番号を入力し、[選択したサービスを追加]タブをクリックします。 フォームの下部にサービスが追加されます。
    3. 「追加情報」ボックスを使用して重要な詳細を追加し、標本リストや方向の説明などの関連ドキュメントを添付/アップロードします。
  6. リクエストはHTRによるレビューが保留され、HTRは必要な変更を加え、承認のために送信します。 更新されたプロジェクトリクエストに関するメールがiLabから届きます。
  1. 組織研究監視委員会(TROC)に提案を提出してください。 カレン・カポビアンコに連絡する このプロセスのガイダンス。
  2. TROCが提案を承認したら、申請書と一緒に承認書をUNMに送信します。 人体実験審査委員会(HRRC)機関審査委員会(IRB).

IRB申請プロセスをナビゲートするには:

  1. 上記のリンクで、左側の「ClickIRB」ボタンをクリックします
  2. 画面上部の[IRB]タブをクリックします
  3. 左側の「新規スタディの作成」ボタンをクリックします
  4. フォームに記入する
  5. 質問#7で、リンクをクリックしてライブラリに移動し、研究に適したプロトコルを選択します
    1. 匿名化された資料のみが必要な研究の場合は、Exempt Category 4 Protocol(HRP-582)を選択してください。 *注:匿名化された廃棄組織は同意を必要としない場合があります
    2. 研究で生きている個人に関する情報を取得する必要がない場合は、Nonhuman Subject Research(HRP-585)を選択してください。
    3. 研究が非研究目的(治療や診断など)のみを目的として収集された標本のみを含む場合は、迅速な提出を提出することができます。
  6. HRRCの承認後、iLabを介してHTRに組織リクエストを送信します。 SRCおよびIRB承認書をアップロードし、システムにアクティブなPRを設定します。
  1. 計画/実現可能性セッションについては、HTR-TASRにお問い合わせください。
  2. 組織研究監視委員会(TROC)に提案を提出してください。 カレン・カポビアンコに連絡する このプロセスのガイダンスについては。
  3. TROCが提案を承認したら、申請書とともに承認書をUNM Human Research Review Committee(HRRC)Institutional Review Board(IRB)に送信します(上記の手順を参照)。
  4. 追加の計画セッションについては、HTR-TASRに連絡してください(通常、プロセスの詳細を明確にするために必要です。この会議には、国の検査規則と最善の患者ケ​​アの遵守を維持しながら、標本の可用性を確保するために外科病理学部門長からの承認を得ることが含まれます。
  5. 調査の終了後に組織が残っている場合は、HTRに戻す必要があります
  1. 収集した組織の一部が研究に使用される可能性がある場合は、地元の人体実験審査委員会から承認を得る必要があります。
  2. 外科病理学部門長またはその被指名人は、臨床ケアのために十分な代表組織が保持されることを保証するために、サンプル収集の方法を承認する必要があります

棚卸

収集された組織のサイト

(UNMからのアーカイブ組織と、特定の研究のための研究者のための前向きコレクションが含まれます。)

  • 膀胱、血液、骨、骨髄、脳、乳房
  • 胸壁、結腸直腸
  • ダイアフラム
  • 胆嚢
  • 頭と首
  • 腎臓
  • 肝臓、肺、リンパ節
  • 縦隔
  • 大網、卵巣
  • 膵臓、陰茎、腹膜、前立腺
  • 唾液、唾液腺、皮膚、小腸、軟部組織、脾臓、胃
  • 精巣、胸腺、甲状腺
  • 子宮と子宮頸部
  • 膣/外陰部

拡張乳がん登録(EBCR)

これは、収集された組織の複数の時点とタイプを持つ400人を超える同意された患者で構成される複雑な組織収集です。 以下は、各患者について収集されました。

  • 最大5血清アリコート/参加者/コレクション(ベースラインまたはFUP時間など)
  • 最大10血漿アリコート/参加者/コレクション
  • 全血/参加者/コレクションからの10個のDNAアリコート
  • うがい薬または綿棒/参加者/コレクションから最大2つのDNAアリコート
  • 乳房組織(穿刺吸引物、バイアル、OCTカビ)-すべての場合が異なります。

このデータセットの詳細なクエリについては、HTR-TASRにお問い合わせください。